股東轉讓出資后，可能出現股東名冊與公司記載之間不一致的情況，對此公司應當及時辦理變更登記，保持股東名冊與公司登記之間的一致性。如果沒有經過登記，或者沒有及時辦理變更登記，則不得對抗第三人，即第三人通過受讓出資等方式成為公司股東并記載于股東名冊后，如果沒有在公司登記機關辦理相關登記的，不能主張該第三人的股東資格無效。

有人認為股權轉讓的生效時間應從辦理工商變更登記之日起生效，依據是國家工商局在《關于股權轉讓有關問題的答復》(工商企字[2000]第262號)“股東轉讓股權，出讓人與受讓人簽訂轉讓協議后，受讓人直接支付出讓人已繳付的出資額，不必再向公司重新入資，經公司變更登記后成為公司股東”的規定。

依據這一規定認定股權轉讓的生效時間是不妥的，理由有二：

1、股權轉讓是當事人之間依雙方的約定而產生的民事法律行為，是雙方之間訂立的合同，根據我國《合同法》第四十四條和最高人民法院《關于適用〈合同法〉若干問題的解釋》第四條的規定，只有法律、行政法規才有權規定合同應當辦理批準、登記手續后生效。現在在我國立法中，還沒有有限責任公司股東轉讓股權，要在辦理工商變更登記手續后才能生效的規定，國家局的文件不是法律、行政法規。

2、國家局的《關于股權轉讓問題的答復》規定與新《公司法》第三十三條第二款的規定即“記載于股東名冊的股東，可以依股東名冊行使股東權利”相悖，根據法律文件的位階和新舊，現在應不予執行。

股權權屬是在什么時候發生轉移的

就內部登記而言(修改公司章程和股東名冊)，公司法和公司章程設立這一制度的基礎在于：首先，股權是一種無形的財產，其權屬的變更無法以實際交付的形式完成;但股權轉讓同時又是一種物權性的履行行為，而根據《物權法》的相關規定，動產物權的設立和轉讓，自交付時發生效力，因此，欲使股權轉讓的行為產生法律上的效力，則必須設定某種方式完成股權的交付。其次，在股權轉讓過程中，股權轉讓協議只能證明相關當事人對股權轉讓確認和同意，不能成為交付的標準，只有在企業章程和股東名冊上進行記載，才能完成法律上的交付。因此，企業章程及股東名冊中對股權變更事項進行登記，就成為股權轉讓協議得以履行完畢必不可少的條件，即內部登記的完成意味著股權的交付和相應物權的轉移，也就是股權權屬在此時發生了轉移。

就外部登記而言(在工商登記機關進行變更登記)，法律之所以創設這一制度，其目的是為了將公司股權的變動對外進行公示，是股權的變更在公司外部得以確認，從而更好的保護債權人和股東的利益。其作用是將股權的所有人予以固定，以便確認相應權利義務的歸屬，對于股權轉讓的實際完成并無影響，在外部登記未完成的情況下，原股東只是喪失了對抗第三人的權利，即工商登記變更也是一個向社會公示的過程，與公司進行交易的善意第三人有權信賴工商登記機關的股東登記，股權轉讓后未向工商行政管理機關辦理股東變更登記，對公司的以外的第三人不產生法律效力。

如果沒有經過登記，或者沒有及時辦理變更登記，則不得對抗第三人。