法院在確定侵犯商業(yè)秘密的實際損失時，應充分考慮各方面的因素，并采取以下4種方式計算賠償數(shù)額：

1、以商業(yè)秘密權利人因侵權行為遭受的損失為賠償額。這種賠償?shù)挠嬎惴绞揭笄趾θ藢τ谏虡I(yè)秘密權利人可計算的財產(chǎn)、收入方面的損失，應全部予以賠償。

通常主要分為三個方面：

(1)研制開發(fā)成本，包括：花費的時間、金錢和付出的努力等，必須將該部分成本計入實際損失。

(2)現(xiàn)實利益損失。使用商業(yè)秘密正在給權利人帶來的利益，涉及到生產(chǎn)成本的降低、銷售額的提高、利潤率的增加等，所以侵犯商業(yè)秘密造成權利人現(xiàn)實利益的喪失屬于實際損失。

(3)最后是將來的競爭優(yōu)勢，即權利人對將來利益的合理預期。因為披露而使商業(yè)秘密喪失，或者不易于責令停止侵權行為的情況，將來競爭優(yōu)勢的喪失往往是實際損失的組成部分。確定此種損失應當考慮商業(yè)秘密的價值、利用周期的長短、市場競爭的程度、市場前景的預期等。當然，如果涉案的商業(yè)秘密尚未被公眾所知悉，則權利人因被侵權所受到的損失可以根據(jù)商業(yè)秘密權利人使用商業(yè)秘密制造、銷售的產(chǎn)品因侵權所造成銷售量減少的總數(shù)乘以每件產(chǎn)品的合理利潤所得之積計算。

權利人銷售量減少的總數(shù)難以確定的，侵權產(chǎn)品在市場上銷售的總數(shù)乘以每件產(chǎn)品的合理利潤所得之積可視為權利人因被侵權所受到的損失。

2、以侵權人因侵權行為獲得的利潤為賠償額。侵權人因侵權所獲得的利益可以根據(jù)該侵權產(chǎn)品在市場上銷售的總數(shù)乘以每件侵權產(chǎn)品的合理利潤所得之積計算。侵權人因侵權所獲得的利益一般按照侵權人的營業(yè)利潤計算，對于完全以侵權為業(yè)的侵權人，可以按照銷售利潤計算。具體來說，對于違法將商業(yè)秘密出賣給他人的，以其違法、出賣的收入為賠償額;對于違法使用商業(yè)秘密進行生產(chǎn)經(jīng)營活動的，以其獲得或增加的利潤為賠償額。商業(yè)秘密權利人的損失往往難以計算，法院通常以侵權人所獲得的利潤作為裁判的依據(jù)。在計算侵權人侵權期間因侵權所獲得的利潤時，不能簡單地以銷售額為獲利額，也不能以已生產(chǎn)的產(chǎn)品的價格總額乘以平均利潤率為獲利額，應當以“銷售額×平均利潤率=獲利額”較為妥當。當這個平均利潤率無法查明時，可委托評估機構進行評估。此外，商業(yè)秘密權利人的損失包括已經(jīng)遭受的損失和必然遭受的損失即直接損失和間接損失，侵權人的獲利是實際獲利，而不包括預期獲利。

3、以不低于商業(yè)秘密許可使用的合理費用為賠償額。當商業(yè)秘密權利人與他人曾簽有商業(yè)秘密許可使用合同時，可采用此種方式計算賠償額。這是假定侵權人在正常情況下取得權利人商業(yè)秘密的許可使用時，其許可使用費應該是多少，再推定該數(shù)額為賠償數(shù)額。當然，使用該方法計算賠償數(shù)額，應綜合考慮侵權人的性質、情節(jié)以及商業(yè)秘密許可的性質、范圍、時間等因素，在不低于許可使用費至該許可使用費的3倍幅度內(nèi)確定;同時還應防止商業(yè)秘密權利人與他人相互串通虛構許可使用合同及許可使用費，以向侵權人收取巨額賠償。

4、定額賠償。定額賠償就是由人民法院根據(jù)案件的具體情況酌情確定賠償額。在知識產(chǎn)權侵權損害賠償中，經(jīng)常出現(xiàn)原告的損失和被告的獲利均無法查明的情況，司法實踐中采取酌情賠償?shù)姆椒▉硖幚怼Ｐ薷暮蟮闹鳈喾ā⑸虡朔ê蛯＠讣乃痉ń忉尪家?guī)定了酌情賠償?shù)臄?shù)額最高不超過50萬元。由于侵犯商業(yè)秘密行為的損害賠償額，可以參照確定侵犯專利權的損害賠償額的方法進行,因此，對于侵犯商業(yè)秘密的損害賠償也應是一般在5000元以上30萬元以下確定賠償數(shù)額，最多不得超過人民幣50萬元。除此之外，當事人自愿協(xié)商賠償額也是實踐中常用的一種方式，只要這種取舍不損害國家、社會或者第三人的合法權益。

對于上述侵犯商業(yè)秘密損害賠償?shù)臄?shù)額計算方法非隨意取舍，而是按照一定的先后順序加以采用，具體表現(xiàn)為：以不正當競爭法第二十條規(guī)定的賠償方法為指導原則并優(yōu)先采用，以各種變通的方法為補充，以定額賠償為最終的保留;即應當以能夠確定權利人的實際損失或推定損失的方法優(yōu)先;其次采用能夠確定的侵權行為人的實際獲利或商業(yè)秘密許可使用費的方法;在上述各種方法均無法確定時，采用定額賠償方法，以切實保護商業(yè)秘密權利人的合法權益。