1、合并方和被合并企業(yè)的初步確定一般通過產(chǎn)權(quán)市場或直接協(xié)商確定合并方和被合并企業(yè)。在實踐中，由于現(xiàn)有產(chǎn)權(quán)市場存在諸多不規(guī)范之處，企業(yè)采取兼并重組的形式，通過直接協(xié)商或自謀對象來確定兼并方和被兼并企業(yè)的情況較為普遍，對被合并企業(yè)的各項資產(chǎn)、負債進行全面、認真的清查，理清債權(quán)債務關系。按照“誰投資、誰所有、誰受益”的原則，對國有資本及其權(quán)益進行核定和界定，防止企業(yè)并購過程中國有資產(chǎn)流失，國有產(chǎn)權(quán)直接持有單位必須決定聘請有資質(zhì)的會計師事務所進行財務審計。企業(yè)合并后轉(zhuǎn)為非國有企業(yè)的，應當對企業(yè)法定代表人進行審計。被合并企業(yè)必須按照有關規(guī)定向會計師事務所或者政府審計部門提供有關財務會計資料和文件

采用合并重組形式的資產(chǎn)評估企業(yè)，必須按照本法的規(guī)定進行資產(chǎn)評估國有資產(chǎn)評估管理辦法。為防止國有資產(chǎn)流失，對合并中轉(zhuǎn)制為股份制企業(yè)的企業(yè)也應進行資產(chǎn)評估。資產(chǎn)評估范圍包括固定資產(chǎn)、流動資產(chǎn)、無形資產(chǎn)（包括知識產(chǎn)權(quán)和商譽，但不包括作為無形資產(chǎn)處理的國有土地使用權(quán)）和其他資產(chǎn)。非國有投資者并購企業(yè)的，由直接持有國有產(chǎn)權(quán)的單位決定聘請有資質(zhì)的資產(chǎn)評估機構(gòu)進行資產(chǎn)評估。其他形式的合并，應當按照《國有資產(chǎn)評估管理辦法》的規(guī)定對國有資產(chǎn)進行評估。首先，被合并企業(yè)應當向國有資產(chǎn)管理部門申請進行項目評估，并提交財產(chǎn)目錄和有關會計報表，由國有資產(chǎn)管理行政部門進行審計。國有資產(chǎn)管理部門批準評估項目的，申請人應當委托評估機構(gòu)進行評估。持有國務院或者省、自治區(qū)、直轄市人民政府國有資產(chǎn)評估資質(zhì)證書的資產(chǎn)評估公司、會計師事務所、審計事務所、財務咨詢公司，以及國務院國有資產(chǎn)管理部門或者省、自治區(qū)、直轄市人民政府依照現(xiàn)行法律、法規(guī)和政策規(guī)定認定的臨時評估機構(gòu)，被合并企業(yè)應當委托上述單位進行資產(chǎn)評估，不得接受上述機構(gòu)的委托進行資產(chǎn)評估。資產(chǎn)評估機構(gòu)接受委托進行資產(chǎn)評估、估計后，應當將資產(chǎn)評估結(jié)果報告報送委托單位，委托人將資產(chǎn)評估報告報送其主管部門審核，經(jīng)主管部門審批后，報同級國有資產(chǎn)管理部門確認資產(chǎn)評估結(jié)果。經(jīng)確認的資產(chǎn)評估結(jié)果，由國有資產(chǎn)管理行政主管部門出具確認通知書。未經(jīng)資產(chǎn)評估而簽訂的銷售協(xié)議，視為無效。（4）確定產(chǎn)權(quán)底價時，被合并企業(yè)應當根據(jù)有關主管部門確認的評估值合理確定銷售底價。交易價格可通過招標確定。成交價格不得低于底價（但允許在底價的基礎上有一定程度的浮動）。浮動價格低于評估價格90%的，由同級國有資產(chǎn)管理部門批準。未按規(guī)定進行評估的，不予辦理產(chǎn)權(quán)變更手續(xù)。采用招標投標方式確定成交價格的，依照招標投標法的規(guī)定辦理。有自謀對象的企業(yè)合并，可以協(xié)商，但協(xié)商價格不得低于評估值確定的底價。被合并企業(yè)為全民所有制企業(yè)的，由國有資產(chǎn)管理部門確定交易價格

交易價格確定后，雙方所有者應當簽訂合并協(xié)議。全民所有制企業(yè)合并，由各級國有資產(chǎn)管理部門審批。尚未設立國有資產(chǎn)管理部門的，由財政部門會同企業(yè)主管部門報同級政府決定。為使并購工作順利進行，應征求被并購企業(yè)職工的意見，做好職工的思想工作。職工不同意合并的，不影響合并協(xié)議的效力。集體所有制企業(yè)合并，應當經(jīng)職工代表大會討論批準，報主管部門備案。集體所有制企業(yè)未經(jīng)職工代表大會批準合并的，合并協(xié)議不生效。合并協(xié)議因未獲通過而無效的，依照合同法關于締約過失責任的規(guī)定處理，實施合同、租賃制度的企業(yè)確定合并時，應當按照有關規(guī)定辦理解除合同手續(xù)。未辦理終止合同手續(xù)的企業(yè)不得合并。合并的，合并方應當按照有關法律、法規(guī)的規(guī)定一次性支付價款；一次性支付確有困難的，經(jīng)雙方協(xié)商，經(jīng)批準國有企業(yè)改制和國有產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓的單位按照有關規(guī)定批準，可以分期支付。分期付款的，首付款不得低于價款的30%，其余由受讓人依法擔保，自首付款之日起一年內(nèi)支付。買方應參照銀行貸款利率向賣方支付未付部分的利息。國有產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移支付的資金，優(yōu)先支付解除勞動合同職工的經(jīng)濟補償金，優(yōu)先支付轉(zhuǎn)移到社會保障機構(gòu)管理的職工的社會保險費，償還企業(yè)欠職工的債務和社會保險費。剩余部分按有關規(guī)定處理

此外，為保護債權(quán)金融機構(gòu)的利益，《關于規(guī)范國有企業(yè)改制的意見》規(guī)定，在改制過程中，必須征得債權(quán)金融機構(gòu)的同意，維護金融債權(quán)，依法履行金融債務。未履行金融債務的企業(yè)不得重組

合并協(xié)議自雙方簽字蓋章之日起生效。需要經(jīng)政府主管部門批準的，合并協(xié)議自批準之日起生效；未經(jīng)批準，合并協(xié)議不得生效。但根據(jù)《合同法》及其相關司法解釋，當事人在一審法院辯論終結(jié)前辦理核準手續(xù)的，合并協(xié)議有效

被合并企業(yè)產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓所得屬于企業(yè)產(chǎn)權(quán)所有人。被合并企業(yè)為全民所有的，除國家另有規(guī)定外，其凈收入由國有資產(chǎn)管理部門上繳國庫。被合并企業(yè)屬于集體所有制的，其凈收入按產(chǎn)權(quán)歸屬歸屬屬于不同所有者的，企業(yè)合并后應當辦理產(chǎn)權(quán)變更登記（含產(chǎn)權(quán)變更登記）