一般的刑事訴訟過程，是案件經(jīng)過公安機關(guān)偵查后，認(rèn)為需要追究刑事責(zé)任的，由公安機關(guān)將案件移送人民檢察院，人民檢察院審查是否需要向人民法院提起公訴。法律規(guī)定，人民檢察院審查案件的時候，主要應(yīng)當(dāng)查明犯罪事實、情節(jié)是否清楚，證據(jù)是否確實充分，犯罪性質(zhì)和罪名的認(rèn)定是否正確，有無遺漏罪行，是否有不應(yīng)追究刑事責(zé)任的情況等。

人民檢察院經(jīng)過審查案件后，可能就有兩種結(jié)果，一是認(rèn)為犯罪嫌疑人的犯罪事實已經(jīng)查清，證據(jù)確實、充分，符合起訴條件，決定向人民法院提起訴訟;二是認(rèn)為不具備起訴條件，不能向人民法院提起訴訟。

在不具備起訴條件的諸多因素中，其中有一種情況就是人民檢察院認(rèn)為犯罪事實不清、證據(jù)不足或者遺漏與定罪量刑有關(guān)的重要情節(jié)，需要補充偵查的。對這種情況，作為起訴一方的人民檢察院由于提不出足以證明犯罪嫌疑人的確鑿證據(jù)，如果再向人民法院提起公訴，就刑事訴訟活動而言是一種不負(fù)責(zé)任的做法，與刑事訴訟法規(guī)定的任務(wù)也是不相吻合的。

因此，刑事訴訟法規(guī)定，人民檢察院審查案件，對于需要補充偵查的，可以退回公安機關(guān)補充偵查，也可以自行偵查。從某種意義上講，這也是人民檢察院對公安機關(guān)偵查活動的一種監(jiān)督。公安機關(guān)應(yīng)當(dāng)認(rèn)真對案件重新進行審查，補充需要的證據(jù)。根據(jù)法律規(guī)定，公安機關(guān)補充偵查是有期限限制的，即公安機關(guān)接到人民檢察院退回補充偵查的案卷材料后，應(yīng)當(dāng)在一個月內(nèi)補充偵查完畢。

在這一個月的補充偵查時間里，如果犯罪嫌疑人原來已被采取了強制措施，如已被逮捕、取保候?qū)徎蛘弑O(jiān)視居住，是否需要變更或取消強制措施，一般應(yīng)由公安機關(guān)決定。公安機關(guān)經(jīng)過補充偵查后，認(rèn)為證據(jù)已經(jīng)確實、充分，足以證明犯罪的，可以再次移送人民檢察院，要求起訴。如果公安機關(guān)在一個月內(nèi)沒有掌握能夠證明犯罪嫌疑人犯罪的證據(jù)，可以作撤銷案件處理。

人民檢察院將案件退回公安機關(guān)補充偵查，公安機關(guān)在一個月內(nèi)補充偵查完后，將案件重新移送檢察院，檢察院依法可以重新計算審查起訴的期限。為了避免司法機關(guān)反復(fù)對同一個案件審查、偵查，無限制地延長訴訟時間，刑事訴訟法對人民檢察院將案件退回公安機關(guān)補充偵查的次數(shù)也作了限制性規(guī)定，即補充偵查以兩次為限。

這就是說，如果公安機關(guān)經(jīng)過兩次補充偵查仍不能掌握足以證明犯罪嫌疑人的證據(jù)的，應(yīng)當(dāng)作撤銷案件處理，不能再移送人民檢察院要求起訴，人民檢察院也不能再退回公安機關(guān)要求補充偵查，應(yīng)當(dāng)作出不起訴決定。