一、非法行醫罪與醫療事故罪

區別在于：1、主體不同。非法行醫罪的主體是沒有醫生執業資格的人，醫療事故罪的主體是有醫生執業資格的醫務人員。2、客觀方面不同。非法行醫罪在客觀方面表現為違反國家有關醫療管理的法律、法規的規定，非法行醫，情節嚴重的行為；醫療事故罪在客觀方面表現為醫務人員在合法的診療護理過程中，違反規章制度，嚴重不負責任，造成嚴重損害就診人健康或者造成就診人死亡的行為，。3、主觀方面不同。非法行醫罪對行為人造成嚴重損害就診人健康或者造成就診人死亡后果，所持的心態既可以是過失，也可以是間接故意，但對于違反醫療管理制度的行為，則是直接故意；醫療事故罪對造成嚴重不良后果所持的心態只能是過失。

二、非法行醫罪與詐騙罪

詐騙罪，是指以非法占有為目的，用虛構事實或者隱瞞真相的辦法，騙取數額較大的公私財物的行為。在客觀方面，詐騙罪與非法行醫罪中行為人根本不懂醫療知識，卻號稱自己精通醫術，牟取就診人錢財的行為極為相似，但二者具有本質的不同：1、客體不同。非法行醫罪侵犯的是國家對醫療機構的管理制度和公眾的生命健康安全，詐騙罪侵犯的客體是單一的，即公私財產的所有權。2、客觀方面不同。非法行醫罪行為人主要是利用就診人缺乏醫療知識，假裝自己醫術高明而欺騙被害人。詐騙罪行為人則是使用騙術，即以虛構事實或者隱瞞真相的欺騙方法，使財物所有人、管理人產生錯覺，信以為真，從而似乎“自愿”地交出財物。3、主體不同。非法行醫罪的主體是特殊主體，即沒有取得醫生執業資格的人。詐騙罪的主體為一般主體，即年滿16周歲能夠負完全刑事責任能力的人。4、主觀方面不同。非法行醫罪表現為間接故意或過失。詐騙罪表現為直接故意。

三、非法行醫罪與非法經營罪

非法經營罪是指違反國家法規，非法進行經營活動，擾亂市場秩序，情節嚴重的行為。它與非法行醫罪的共同之處表現為，都是違背國家許可證制度，都必須情節嚴重才構成。二者的區別在：1、客體不同。非法行醫罪侵犯的客體是國家對醫療機構的管理制度和公眾的生命健康安全，非法經營罪侵犯的客體是市場管理秩序，一般并不侵犯公民的生命健康權利。2、客觀方面不同。非法行醫罪表現為非法從事醫療活動，而非法經營罪表現為非法從事醫療活動以外的其他經營活動。3、主體不同。非法行醫罪的主體是特殊主體，即通常具備一定的醫學知識但未取得醫生執業資格的人，非法經營罪的主體是一般主體。

四、非法行醫罪與故意殺人罪、故意傷害罪和過失致人死亡罪、過失致人重傷罪

非法行醫罪的客觀特征有多種表現，但其中一種危害結果是造成就診人員傷亡，這與故意殺人罪、故意傷害罪、過失致人死亡罪和過失致人重傷罪的后果有相同之處，在司法實踐當中非法行醫罪與上述四罪很容易混淆。筆者認為，非法行醫罪與上述四罪的區別在：1、客體不同。非法行醫罪侵害的客體是國家對醫療機構的管理制度和公眾的生命健康安全，而后四罪所侵犯的客體僅是特定公民的生命健康權利。2、客觀方面不同。非法行醫罪發生在非法從事醫療活動的過程中，而后四罪的發生一般都不在醫療活動的過程中。3、非法行醫罪的主體是特殊主體，限于未取得醫生執業資格的人，而后四罪的主體是一般主體。主觀方面不同。非法行醫罪的行為人對嚴重不良后果的心理態度是過失或間接故意，而故意殺人罪、故意傷害罪的主觀方面為直接故意或間接故意；過失致人死亡、過失致人重傷的主觀方面為過失。