行政處罰時效制度是規(guī)范行政機(jī)關(guān)行使行政處罰權(quán)的制度。超過時效期限，行政機(jī)關(guān)對違法行為不得再作處罰，人民法院對申請強(qiáng)制執(zhí)行處罰決定的不予受理。由于藥品監(jiān)管法律法規(guī)對有關(guān)時效未作規(guī)定，所以應(yīng)按《行政處罰法》的有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

追訴時效

《行政處罰法》第29條規(guī)定，違法行為在二年內(nèi)未被發(fā)現(xiàn)的，不再給予行政處罰，法律另有規(guī)定的除外。上述二年期限即是對違法行為給予行政處罰的追究時效。藥品監(jiān)管部門對違反《藥品管理法》和《醫(yī)療器械監(jiān)督管理條例》等法律法規(guī)的行為給予行政處罰的追訴時效，適用于《行政處罰法》規(guī)定的二年時效。二年時效制度的適用條件是，違法行為發(fā)生后在二年內(nèi)行政機(jī)關(guān)沒有發(fā)現(xiàn)。超過二年才發(fā)現(xiàn)的，行政機(jī)關(guān)喪失處罰的權(quán)力。值得探討的是，如何界定“發(fā)現(xiàn)”。我國《刑法》第88條規(guī)定，在司法機(jī)關(guān)立案偵查或受理案件之后，犯罪嫌疑人逃避偵查或?qū)徟械模皇茏吩V期限的限制。行政機(jī)關(guān)對違法行為的“發(fā)現(xiàn)”也應(yīng)當(dāng)以是否立案作為界定的依據(jù)，即在違法行為發(fā)生之后二年內(nèi)，如行政機(jī)關(guān)已立案調(diào)查，就不受二年時效的限制。為防止違法行為人利用二年時效制度逃避法律的追究，行政機(jī)關(guān)對于違法嫌疑人下落不明的重大違法案件應(yīng)依法予以立案，使追訴時效中斷，便于今后有效地行使行政處罰權(quán)。追訴時效期限起點的計算，《行政處罰法》第29條第二款規(guī)定從違法行為發(fā)生之日起計算，違法行為有連續(xù)或繼續(xù)狀態(tài)的，從行為終了之日起計算。

裁決時效

行政處罰的裁決時效是指行政機(jī)關(guān)立案調(diào)查后必須作出行政處罰決定的期限。《行政處罰法》未規(guī)定嚴(yán)格意義上的裁決時效，一些行政法規(guī)和部門規(guī)章有相關(guān)規(guī)定，如《藥品監(jiān)督行政處罰程序》(將于7月1日廢止)第26條規(guī)定，藥品監(jiān)管部門應(yīng)當(dāng)在立案之日起三個月內(nèi)作出行政處罰決定。上述規(guī)定實為辦案期限，是對行政機(jī)關(guān)辦案工作效率的要求，而并非法律意義上的裁決時效，因為并沒有規(guī)定未能在法定期限內(nèi)辦結(jié)案件的法律后果。為了提高行政效率，及時處罰違法行為，制定嚴(yán)格意義上的行政處罰裁決時效是必要且可行的。

執(zhí)行時效

執(zhí)行時效是指行政機(jī)關(guān)強(qiáng)制執(zhí)行或申請人民法院強(qiáng)制執(zhí)行行政處罰決定的期限。《行政處罰法》未對行政處罰決定的執(zhí)行時效作出規(guī)定。由于大多數(shù)行政機(jī)關(guān)本身并無自行強(qiáng)制執(zhí)行的權(quán)力，只能申請人民法院強(qiáng)制執(zhí)行。因此，這里探討的執(zhí)行時效是指申請人民法院強(qiáng)制執(zhí)行的時效。《行政處罰法》第51條、《藥品監(jiān)督行政處罰程序規(guī)定》(將于7月1日起施行)第59條規(guī)定，當(dāng)事人在法定期限內(nèi)不申請行政復(fù)議或不提起行政訴訟又不履行處罰決定的，藥品監(jiān)管部門可申請人民法院強(qiáng)制執(zhí)行。最高人民法院《關(guān)于執(zhí)行〈中華人民共和國行政訴訟法〉若干問題的解釋》第88條規(guī)定，行政機(jī)關(guān)申請人民法院強(qiáng)制執(zhí)行具體行政行為，應(yīng)當(dāng)自被執(zhí)行人的法定起訴期限屆滿之日起180日內(nèi)提出，逾期申請的，除有正當(dāng)理由外，人民法院不予受理。超過此時限，行政機(jī)關(guān)則喪失申請強(qiáng)制執(zhí)行的權(quán)力。