根據(jù)《中華人民共和國土地管理法》第五十三條規(guī)定，經(jīng)批準(zhǔn)的建設(shè)項目需要使用國有建設(shè)用地的，建設(shè)單位應(yīng)當(dāng)持法律、行政法規(guī)規(guī)定的有關(guān)文件，向有批準(zhǔn)權(quán)的縣級以上人民政府土地行政主管部門申請建設(shè)用地，報經(jīng)縣級以上人民政府批準(zhǔn)的土地行政主管部門審批省級。需要使用國有土地的建設(shè)項目可以分為兩類。一類是申請使用現(xiàn)有國有建設(shè)用地。根據(jù)規(guī)定，該類只需向所在地縣、市人民政府土地行政主管部門提出申請，經(jīng)土地行政主管部門審核后報縣、市人民政府批準(zhǔn)；另一類是經(jīng)省級以上人民政府批準(zhǔn)，申請使用國有農(nóng)用地或者集體所有的建設(shè)用地、農(nóng)用地，涉及農(nóng)用地轉(zhuǎn)用、征用的，縣、市人民政府應(yīng)當(dāng)按照省級以上人民政府的批準(zhǔn)文件辦理建設(shè)用地手續(xù)。在這種情況下，B公司申請的土地屬于后一類，即集體所有的農(nóng)業(yè)用地。

根據(jù)《土地管理法》的有關(guān)規(guī)定，無論使用哪種土地，B公司都應(yīng)向a縣人民政府土地行政主管部門申請土地使用權(quán)。農(nóng)用地轉(zhuǎn)用征用審批是a縣人民政府向上級政府的事，B公司只需按規(guī)定提供相關(guān)資料。用地批準(zhǔn)后，由a縣人民政府土地行政主管部門通知B公司，并負責(zé)辦理建設(shè)用地的相關(guān)手續(xù)，包括簽訂用地合同和收取相關(guān)費用。具體步驟如下：

1。市、縣國土資源局在被征地村下發(fā)征地通知書，告知村集體經(jīng)濟組織和村民征地范圍、面積、補償方式、補償標(biāo)準(zhǔn)、安置方式、征地目的，等種植的農(nóng)作物或者公告后修建的建筑物，不納入補償范圍。二是市、縣國土資源局會同被征收土地的鄉(xiāng)鎮(zhèn)政府，就征地通知書的內(nèi)容征求村集體經(jīng)濟組織和農(nóng)民的意見。有不同意見的，應(yīng)當(dāng)按照村委會或者村民的意見分別記錄處理。

村委會、村民對補償標(biāo)準(zhǔn)、安置方式、補償方式有異議的，由被征收土地的市、縣國土資源局或者鄉(xiāng)政府通知土地相對人，有權(quán)申請聽證依法組織聽證。三是市、縣國土資源局會同被征收土地的所有者和使用者，對被征收土地的四界、土地用途、土地面積、地上附著物的種類、數(shù)量、規(guī)格等進行實地調(diào)查，填寫調(diào)查表一式三份，確認后由國土資源局工作人員、業(yè)主、使用人簽字。協(xié)議的主要內(nèi)容由農(nóng)村集體經(jīng)濟組織或者村民委員會按照村民代表大會或者村民代表大會程序等民主程序決定。

以村委會為征收主體的，由農(nóng)村集體經(jīng)濟組織或者村民委員會簽訂協(xié)議后，向農(nóng)村村民公示征地補償安置協(xié)議。

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