一、貫徹迅速秘密偵查運(yùn)行機(jī)制。這項(xiàng)機(jī)制中，兩個(gè)因素至關(guān)重要。一要堅(jiān)持嚴(yán)管線索，確保在秘密中謀劃初查。為防止線索因管理分散而失密，有必要實(shí)行檢察長統(tǒng)一管理重大案件線索的工作機(jī)制。同時(shí)，還應(yīng)建立健全上級院領(lǐng)導(dǎo)管理下級院的案件線索及其處理情況工作機(jī)制。上一級院檢察長可以要求下一級院檢察長每月匯報(bào)一次案件線索收集處理情況，實(shí)現(xiàn)有效整合和充分利用。本院檢察長應(yīng)當(dāng)對有關(guān)線索逐個(gè)評估。制定初查方案時(shí)，堅(jiān)持個(gè)別交辦、有限知情，嚴(yán)防泄密，嚴(yán)防初查未啟動、說情已上門的現(xiàn)象。二要堅(jiān)持兵貴神速，爭取在秘密中結(jié)束初查。在初查過程中，應(yīng)當(dāng)堅(jiān)持先外后內(nèi)，先盡力獲取物證、書證等客觀性證據(jù)，再收集證人證言等主觀性證據(jù)，把直接接觸初查對象放在初查的最后環(huán)節(jié)。一旦啟動初查，必須以快制勝，確保立案或采取強(qiáng)制措施前不走漏任何消息，保障偵查順利進(jìn)行。

二、健全案件質(zhì)量前瞻后延機(jī)制。實(shí)踐中，偵查人員時(shí)常就一些定罪存在爭議、證據(jù)難以把握的案件向偵監(jiān)、公訴部門咨詢，這種個(gè)別化、無序化的咨詢方式不利于職務(wù)犯罪偵查工作的健康發(fā)展。為此，有必要建立健全案件質(zhì)量前瞻后延的工作機(jī)制。

一是建立健全案件質(zhì)量前瞻運(yùn)行機(jī)制。從初查開始，偵查部門就要以保障順利起訴、判決的眼光，認(rèn)真全面細(xì)致地收集證據(jù)。批捕起訴部門也要及時(shí)提供指導(dǎo)性、針對性意見，要明確偵監(jiān)、公訴部門依法介入的時(shí)間和任務(wù)。偵監(jiān)部門立足于法定逮捕條件，對收集、固定、保全證據(jù)提出建議意見，并就事實(shí)證據(jù)及法律適用提出意見，審查準(zhǔn)備移送的案卷材料是否齊備。公訴部門立足于法庭舉證要求，從起訴角度，對收集、固定證據(jù)及完善證據(jù)體系等提出建議;審查案卷材料是否齊備、強(qiáng)制措施是否適當(dāng)，并對有關(guān)問題提出改進(jìn)建議。

二是建立健全偵結(jié)后的質(zhì)量跟蹤機(jī)制。偵查部門的視角要向后續(xù)的訴訟階段延伸，負(fù)責(zé)跟蹤協(xié)助出庭公訴，共同補(bǔ)強(qiáng)證據(jù)。建立偵查人員到庭旁聽制度，要求偵查人員樹立庭審意識，在開庭時(shí)直觀感受對案件事實(shí)和證據(jù)的辯論;判決后，還要對照整套法律文書，認(rèn)真分析判決認(rèn)定事實(shí)、采信證據(jù)、適用法律與移送起訴、公訴階段的異同之處，并寫出分析報(bào)告，促進(jìn)偵查質(zhì)量的提高。

三、健全合并偵查機(jī)制。鑒于瀆職侵權(quán)與貪污賄賂行為常常交織在一起，為有效懲治職務(wù)犯罪，有必要把反瀆與反貪工作緊密結(jié)合起來，形成偵查合力。一是嘗試通過查清瀆職犯罪，為取得反貪案件的突破掃除障礙。在查辦貪污賄賂犯罪案件時(shí)，往往因犯罪隱蔽、偵查手段缺乏、訊問時(shí)間限制而難以突破。此時(shí)需要及時(shí)改變策略，先查瀆職，為反貪鋪路。二是嘗試通過深挖貪污賄賂線索，為實(shí)現(xiàn)反瀆案件的突破暗度陳倉。如果僅就瀆職線索查辦瀆職案件，社會理解程度相對較低，法院量刑相對較輕，辦案效果難以提升。為得到更多理解和支持，要不斷擴(kuò)大反瀆辦案的社會效果，有的市縣區(qū)院通過探索以深挖貪污賄賂犯罪為查辦反瀆案件作“總結(jié)”的聯(lián)合辦案模式，取得了較好的法律效果和社會效果。

四、健全偵查指揮組織領(lǐng)導(dǎo)機(jī)制。偵查工作的科學(xué)發(fā)展，需要設(shè)立能夠有效整合辦案資源的偵查指揮組織領(lǐng)導(dǎo)機(jī)構(gòu)，從而形成縱向指揮有力、橫向協(xié)作緊密、運(yùn)轉(zhuǎn)高效有序的工作格局。而分散型模式已不具備在新形勢下實(shí)現(xiàn)偵查工作科學(xué)發(fā)展的優(yōu)勢，近年來部分省市縣院就有整合偵查部門的成功實(shí)踐。

五、完善內(nèi)部配合協(xié)調(diào)機(jī)制。按照分工負(fù)責(zé)與資源整合要求，切實(shí)加強(qiáng)職務(wù)犯罪偵查工作中的內(nèi)部協(xié)作協(xié)調(diào)配合機(jī)制，增強(qiáng)整體合力。從橫向角度，要堅(jiān)持舉報(bào)中心歸口受理舉報(bào)線索，同時(shí)由指揮中心負(fù)責(zé)統(tǒng)一管理線索，統(tǒng)一交辦案件，尤其是統(tǒng)一協(xié)調(diào)需要多部門參與辦理的案件。民行檢察部門應(yīng)當(dāng)發(fā)揮熟悉民事行政訴訟規(guī)律的特長，在辦案中發(fā)現(xiàn)司法不公背后的職務(wù)犯罪線索時(shí)，可按照規(guī)定進(jìn)行初查，或根據(jù)檢察長指令移送并配合查辦。監(jiān)所檢察部門查辦案件時(shí)要主動爭取反貪、瀆檢部門的支持配合，必要時(shí)及時(shí)移交反貪、瀆檢部門。

充分發(fā)揮法醫(yī)、理化、文檢、痕檢、司法會計(jì)等科技手段在偵查中的作用，有效運(yùn)用科技手段和現(xiàn)代設(shè)備，固定保全和鑒別證據(jù)，提高自偵工作信息化程度以及科技實(shí)力向現(xiàn)實(shí)戰(zhàn)斗力轉(zhuǎn)化的能力。從縱向角度，健全以省院為龍頭，各地市縣區(qū)院為支點(diǎn)的檢察系統(tǒng)內(nèi)部配合協(xié)作體制。必要時(shí)，對案情重大復(fù)雜、社會反映強(qiáng)烈、需要跨區(qū)域偵查、下級院偵查確有困難或組織偵查不力的大要案，采取組織專項(xiàng)偵查、實(shí)施專案偵查、交辦、指定異地管轄、參辦、督辦、提辦等多種偵查指揮方式，發(fā)揮整體優(yōu)勢，排除干擾阻力，有效查辦案件。