征地補償糾紛不予受理的原因有：

一、涉及面廣，易引發(fā)群體性事件。農(nóng)村集體所有的土地已經(jīng)被分配給農(nóng)民個人了，因公共利益的原因被征用的土地面積較大，涉及的農(nóng)戶較多。村委會或村民組在對被征地農(nóng)戶補償其應得的青苗補償費及地上附屬物補償款后，對剩余的款項在本集體經(jīng)濟組織內(nèi)部進行分配，因分配不公而在內(nèi)部引起糾紛。征地補償費在實際的分配過程中鄉(xiāng)村截留多，農(nóng)民實得少。鄉(xiāng)村兩級往往將矛盾上移，問題上交，而法院司法判決認定與村民自治實際情況存在有差距，易與村民自治發(fā)生沖突，導致集體經(jīng)濟組織及鄉(xiāng)鎮(zhèn)人民政府對司法裁判的抱怨與不滿，極易引發(fā)群體性事件。

二、農(nóng)村土地征收補償糾紛案件是否應當受理不確定。按《最高人民法院關(guān)于審理涉及農(nóng)村土地承包糾紛案件適用法律問題的解釋》第1條規(guī)定：“承包地征收補償費用分配糾紛，人民法院應當依法受理。集體經(jīng)濟組織成員就用于分配的土地補償費數(shù)額提起民事訴訟的，人民法院不予受理?！钡?4條規(guī)定：“農(nóng)村集體經(jīng)濟組織或者村民委員會、村民小組，可以依照法律規(guī)定的民主議定程序，決定在本集體經(jīng)濟組織內(nèi)部分配已經(jīng)收到的土地補償費。征地補償安置方案確定時已經(jīng)具有本集體經(jīng)濟組織成員資格的人，請求支付相應份額的，應予支持?！卑雌鋬?nèi)容分析，“份額”應是一種權(quán)利等分的表述，主張的是支持權(quán)利，如果原告起訴要求取得一定的權(quán)利，就涉及到村民待遇問題。根據(jù)《中華人民共和國村民委員會組織法》的規(guī)定，村民委員會是村民自我管理、自我教育、自我服務(wù)的基層組織。村民或集體經(jīng)濟組織成員資格在目前不是法院可以確認的。因此，對于農(nóng)村土地征收補償糾紛案件，法院是否應予受理，各地作法不一。一些法院予以受理，而一些地方則明確下文對涉及農(nóng)村土地征收補償糾紛案件法院不能受理。實踐中有些法院或法官不愿碰或不敢碰這類案件，一旦處理不好就極易造成當事人的群體上訪，給社會穩(wěn)定埋下隱患。

三、補償標準不統(tǒng)一，地區(qū)差異大。目前我國土地征收補償標準采用法定補償標準，由《土地管理法》第四十七條具體規(guī)定，其中有些補償標準只有最高限的限制，即使有些有法定最低標準的限制，但政府的自由裁決權(quán)比較大，如“征收耕地的土地補償費，為該耕地被征收前三年平均年產(chǎn)值的六至十倍”、“征收其他土地補償費和安里補助費標準，由省、自治區(qū)、直轄市參照征收耕地的土地補償費和安置費的標準規(guī)定”，較大的自由浮動幅度賦予了政府極大的自由裁決權(quán)，各地適用的標準不一致，造成地區(qū)間土地征收補償標準差異大。

四、案件裁判后難執(zhí)行兌現(xiàn)。涉訴集體經(jīng)濟組織在土地補償費到手后往往即用于成員分配，法院裁判后集體經(jīng)濟組織常無財產(chǎn)可供執(zhí)行?，F(xiàn)實中，案件申請執(zhí)行人因法院裁判無法執(zhí)行而上訪的事例屢見不鮮，這種情況下司法權(quán)威將受到極大影響。

在征地補償安置中，農(nóng)民往往會對補償標準產(chǎn)生質(zhì)疑，各個地區(qū)情況也不一樣，因此為了減少糾紛，各地方的政府官員以及開放商應該和農(nóng)民代表一起組織集體會議，共同協(xié)商征地補償標準，避免引發(fā)群體性事件。

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