依據(jù)我國(guó)相關(guān)法律的規(guī)定，通過(guò)設(shè)卡攔截交通等方式隔離疫情是合法的，傳染病蔓延時(shí)，政府部門(mén)有權(quán)采取緊急措施防控疫情。

二、相關(guān)法律規(guī)定

《中華人民共和國(guó)傳染病防治法》

第三十九條?醫(yī)療機(jī)構(gòu)發(fā)現(xiàn)甲類傳染病時(shí)，應(yīng)當(dāng)及時(shí)采取下列措施：

(一)對(duì)病人、病原攜帶者，予以隔離治療，隔離期限根據(jù)醫(yī)學(xué)檢查結(jié)果確定;

(二)對(duì)疑似病人，確診前在指定場(chǎng)所單獨(dú)隔離治療;

(三)對(duì)醫(yī)療機(jī)構(gòu)內(nèi)的病人、病原攜帶者、疑似病人的密切接觸者，在指定場(chǎng)所進(jìn)行醫(yī)學(xué)觀察和采取其他必要的預(yù)防措施。

拒絕隔離治療或者隔離期未滿擅自脫離隔離治療的，可以由公安機(jī)關(guān)協(xié)助醫(yī)療機(jī)構(gòu)采取強(qiáng)制隔離治療措施。

醫(yī)療機(jī)構(gòu)發(fā)現(xiàn)乙類或者丙類傳染病病人，應(yīng)當(dāng)根據(jù)病情采取必要的治療和控制傳播措施。

醫(yī)療機(jī)構(gòu)對(duì)本單位內(nèi)被傳染病病原體污染的場(chǎng)所、物品以及醫(yī)療廢物，必須依照法律、法規(guī)的規(guī)定實(shí)施消毒和無(wú)害化處置。

第四十二條?傳染病暴發(fā)、流行時(shí)，縣級(jí)以上地方人民政府應(yīng)當(dāng)立即組織力量，按照預(yù)防、控制預(yù)案進(jìn)行防治，切斷傳染病的傳播途徑，必要時(shí)，報(bào)經(jīng)上一級(jí)人民政府決定，可以采取下列緊急措施并予以公告：

(一)限制或者停止集市、影劇院演出或者其他人群聚集的活動(dòng);

(二)停工、停業(yè)、停課;

(三)封閉或者封存被傳染病病原體污染的公共飲用水源、食品以及相關(guān)物品;

(四)控制或者撲殺染疫野生動(dòng)物、家畜家禽;

(五)封閉可能造成傳染病擴(kuò)散的場(chǎng)所。

上級(jí)人民政府接到下級(jí)人民政府關(guān)于采取前款所列緊急措施的報(bào)告時(shí)，應(yīng)當(dāng)即時(shí)作出決定。

緊急措施的解除，由原決定機(jī)關(guān)決定并宣布。